Zmiana układu rządowego w Niemczech, z którą branża biopaliw wiązała duże nadzieję, nie spowodowała zasadniczej zmiany polityki w zakresie opodatkowania biopaliw. Pod koniec 2009 r. nowy niemiecki parlament zdecydował o utrzymaniu w latach 2010-2012 stawki akcyzy na czysty biodiesel (B100) i oleje roślinne. W opinii branży niskie ceny oleju napędowego sprawią jednak, że zużycie czystego biodiesla w Niemczech nie wzrośnie.
Stawki akcyzy zostały utrzymane w przypadku B100 w wysokości 185,96 euro/m3, a na oleje roślinne 184,55 euro/m3. Rząd niemiecki zdecydował jednocześnie, o dwuipółkrotnym jej wzroście odpowiednio do 450,33 i 450,00 euro/t od roku 2013.
Specjaliści oceniają jednak, że nie można oczekiwać również w najbliższym czasie trwałej poprawy sytuacji w tym sektorze. Ich zdaniem zamierzony wzrost opodatkowania biopaliw od 2013 r. oznacza kontynuację polityki zmierzającej do zrównania stawek opodatkowania biopaliw z paliwami tradycyjnymi.